MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei K96243 chromosome 1

Total Repeats: 109372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006350	CTG	2	6	22	27	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
2	NC_006350	CGT	2	6	84	89	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
3	NC_006350	CG	3	6	93	98	0 %	0 %	50 %	50 %	53717640
4	NC_006350	GC	3	6	108	113	0 %	0 %	50 %	50 %	53717640
5	NC_006350	TCG	2	6	119	124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
6	NC_006350	CG	4	8	130	137	0 %	0 %	50 %	50 %	53717640
7	NC_006350	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717640
8	NC_006350	GCG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717640
9	NC_006350	GTC	2	6	289	294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717640
10	NC_006350	CAG	2	6	322	327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717640
11	NC_006350	GC	3	6	331	336	0 %	0 %	50 %	50 %	53717640
12	NC_006350	CG	3	6	367	372	0 %	0 %	50 %	50 %	53717640
13	NC_006350	CGAC	2	8	375	382	25 %	0 %	25 %	50 %	53717640
14	NC_006350	GCG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717640
15	NC_006350	GAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717640
16	NC_006350	GC	3	6	531	536	0 %	0 %	50 %	50 %	53717640
17	NC_006350	CGA	2	6	613	618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717640
18	NC_006350	AAC	2	6	671	676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53717640
19	NC_006350	GCGCG	2	10	772	781	0 %	0 %	60 %	40 %	53717640
20	NC_006350	CGCT	2	8	794	801	0 %	25 %	25 %	50 %	53717640
21	NC_006350	TGCG	2	8	814	821	0 %	25 %	50 %	25 %	53717640
22	NC_006350	GCC	3	9	823	831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717640
23	NC_006350	TGA	2	6	993	998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717640
24	NC_006350	TCGCG	2	10	1166	1175	0 %	20 %	40 %	40 %	53717641
25	NC_006350	GAC	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
26	NC_006350	GCA	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
27	NC_006350	CGA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
28	NC_006350	GAC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
29	NC_006350	CG	3	6	1257	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	53717641
30	NC_006350	GTC	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
31	NC_006350	CGAG	2	8	1337	1344	25 %	0 %	50 %	25 %	53717641
32	NC_006350	CGA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
33	NC_006350	GC	3	6	1439	1444	0 %	0 %	50 %	50 %	53717641
34	NC_006350	GCCC	2	8	1454	1461	0 %	0 %	25 %	75 %	53717641
35	NC_006350	GCG	2	6	1462	1467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717641
36	NC_006350	ACG	2	6	1484	1489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
37	NC_006350	AGCC	2	8	1522	1529	25 %	0 %	25 %	50 %	53717641
38	NC_006350	GAT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717641
39	NC_006350	AGC	3	9	1597	1605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
40	NC_006350	TCG	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
41	NC_006350	CGA	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
42	NC_006350	TCG	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
43	NC_006350	TCG	2	6	1697	1702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
44	NC_006350	GCGA	2	8	1734	1741	25 %	0 %	50 %	25 %	53717641
45	NC_006350	CGA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
46	NC_006350	AGAT	2	8	1774	1781	50 %	25 %	25 %	0 %	53717641
47	NC_006350	TCG	2	6	1793	1798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
48	NC_006350	CAGC	2	8	1827	1834	25 %	0 %	25 %	50 %	53717641
49	NC_006350	TGA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717641
50	NC_006350	CG	3	6	1917	1922	0 %	0 %	50 %	50 %	53717641
51	NC_006350	GATCGC	2	12	1965	1976	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	53717641
52	NC_006350	ATC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717641
53	NC_006350	AGC	3	9	2011	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
54	NC_006350	CGAGCA	2	12	2027	2038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
55	NC_006350	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717641
56	NC_006350	CAG	3	9	2130	2138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
57	NC_006350	GAG	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	53717641
58	NC_006350	GTC	2	6	2172	2177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717641
59	NC_006350	GCCGAA	2	12	2196	2207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
60	NC_006350	CGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717641
61	NC_006350	CGC	2	6	2279	2284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717641
62	NC_006350	CGG	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717641
63	NC_006350	GC	3	6	3137	3142	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
64	NC_006350	GC	3	6	3153	3158	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
65	NC_006350	GATC	2	8	3161	3168	25 %	25 %	25 %	25 %	161723216
66	NC_006350	GCG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
67	NC_006350	GCC	2	6	3241	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
68	NC_006350	CG	3	6	3257	3262	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
69	NC_006350	CG	4	8	3294	3301	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
70	NC_006350	GCC	3	9	3331	3339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
71	NC_006350	CG	4	8	3341	3348	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
72	NC_006350	GCC	3	9	3349	3357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
73	NC_006350	TCG	2	6	3358	3363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
74	NC_006350	CGA	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
75	NC_006350	TCGC	2	8	3391	3398	0 %	25 %	25 %	50 %	161723216
76	NC_006350	GC	3	6	3428	3433	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
77	NC_006350	GCA	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
78	NC_006350	CG	3	6	3509	3514	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
79	NC_006350	ACG	2	6	3580	3585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
80	NC_006350	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
81	NC_006350	GC	3	6	3620	3625	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
82	NC_006350	CGG	2	6	3630	3635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
83	NC_006350	CAG	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
84	NC_006350	GC	3	6	3693	3698	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
85	NC_006350	CGA	4	12	3716	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
86	NC_006350	TCG	2	6	3743	3748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
87	NC_006350	GC	4	8	3764	3771	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
88	NC_006350	CGC	3	9	3782	3790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
89	NC_006350	CG	3	6	3799	3804	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
90	NC_006350	CGA	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
91	NC_006350	GCG	2	6	3868	3873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
92	NC_006350	GCC	2	6	3885	3890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
93	NC_006350	CAGC	2	8	3900	3907	25 %	0 %	25 %	50 %	161723216
94	NC_006350	CGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
95	NC_006350	CG	3	6	3950	3955	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
96	NC_006350	CGGC	2	8	3974	3981	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
97	NC_006350	TG	3	6	4054	4059	0 %	50 %	50 %	0 %	161723216
98	NC_006350	GC	3	6	4081	4086	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
99	NC_006350	GC	4	8	4091	4098	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
100	NC_006350	GC	3	6	4126	4131	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
101	NC_006350	TCG	2	6	4153	4158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
102	NC_006350	CG	4	8	4157	4164	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
103	NC_006350	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161723216
104	NC_006350	CGG	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
105	NC_006350	CTCG	2	8	4203	4210	0 %	25 %	25 %	50 %	161723216
106	NC_006350	CGC	2	6	4222	4227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
107	NC_006350	CG	4	8	4250	4257	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
108	NC_006350	CGA	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
109	NC_006350	TCGCG	2	10	4307	4316	0 %	20 %	40 %	40 %	161723216
110	NC_006350	ACGC	2	8	4331	4338	25 %	0 %	25 %	50 %	161723216
111	NC_006350	GGC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
112	NC_006350	GGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
113	NC_006350	GCGCG	2	10	4365	4374	0 %	0 %	60 %	40 %	161723216
114	NC_006350	CGA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
115	NC_006350	TCG	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
116	NC_006350	GC	4	8	4448	4455	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
117	NC_006350	CG	3	6	4491	4496	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
118	NC_006350	TCG	2	6	4498	4503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
119	NC_006350	TTC	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161723216
120	NC_006350	GC	4	8	4589	4596	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
121	NC_006350	GCA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
122	NC_006350	GAGCGT	2	12	4638	4649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161723216
123	NC_006350	CGT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
124	NC_006350	TCG	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161723216
125	NC_006350	GCG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
126	NC_006350	CG	3	6	4782	4787	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
127	NC_006350	CG	4	8	4799	4806	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
128	NC_006350	GCTC	2	8	4930	4937	0 %	25 %	25 %	50 %	161723216
129	NC_006350	GCC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161723216
130	NC_006350	GC	3	6	4997	5002	0 %	0 %	50 %	50 %	161723216
131	NC_006350	GCG	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161723216
132	NC_006350	GAC	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161723216
133	NC_006350	AACA	2	8	5491	5498	75 %	0 %	0 %	25 %	53717643
134	NC_006350	CGC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717643
135	NC_006350	CTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	53717643
136	NC_006350	AAG	2	6	5584	5589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	53717643
137	NC_006350	GC	3	6	5649	5654	0 %	0 %	50 %	50 %	53717643
138	NC_006350	GC	3	6	5656	5661	0 %	0 %	50 %	50 %	53717643
139	NC_006350	GTC	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717644
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141	NC_006350	TCGTGA	2	12	5933	5944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	53717644
142	NC_006350	GCCC	2	8	5980	5987	0 %	0 %	25 %	75 %	53717644
143	NC_006350	CTTGC	2	10	5995	6004	0 %	40 %	20 %	40 %	53717644
144	NC_006350	CG	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	53717644
145	NC_006350	CGC	3	9	6052	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717644
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249	NC_006350	ATC	2	6	10387	10392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53717646
250	NC_006350	ACA	2	6	10472	10477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	53717646
251	NC_006350	GAC	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717646
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254	NC_006350	GCG	2	6	10578	10583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
255	NC_006350	CAG	2	6	10585	10590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	53717646
256	NC_006350	CCGC	2	8	10597	10604	0 %	0 %	25 %	75 %	53717646
257	NC_006350	GC	3	6	10613	10618	0 %	0 %	50 %	50 %	53717646
258	NC_006350	CGG	3	9	10619	10627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	53717646
259	NC_006350	CCGT	2	8	10659	10666	0 %	25 %	25 %	50 %	53717646
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261	NC_006350	GC	3	6	10711	10716	0 %	0 %	50 %	50 %	53717647
262	NC_006350	CGC	2	6	10727	10732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	53717647
263	NC_006350	GGCC	2	8	10760	10767	0 %	0 %	50 %	50 %	53717647
264	NC_006350	AGCG	2	8	10815	10822	25 %	0 %	50 %	25 %	53717647
265	NC_006350	CG	3	6	10850	10855	0 %	0 %	50 %	50 %	53717647
266	NC_006350	GCCG	2	8	10886	10893	0 %	0 %	50 %	50 %	53717647
267	NC_006350	CG	3	6	10925	10930	0 %	0 %	50 %	50 %	53717647
268	NC_006350	TCG	2	6	10954	10959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	53717647
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302	NC_006350	CG	4	8	12243	12250	0 %	0 %	50 %	50 %	53717648
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391	NC_006350	CCGCC	2	10	15109	15118	0 %	0 %	20 %	80 %	53717652
392	NC_006350	CG	3	6	15128	15133	0 %	0 %	50 %	50 %	53717652
393	NC_006350	CG	3	6	15136	15141	0 %	0 %	50 %	50 %	53717652
394	NC_006350	GAT	2	6	15149	15154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	53717652
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398	NC_006350	CG	3	6	15248	15253	0 %	0 %	50 %	50 %	53717652
399	NC_006350	ACGG	2	8	15436	15443	25 %	0 %	50 %	25 %	53717652
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